Нагато силен как минимум своим философским складом ума. Изречения сироты из Амегакуре, члена клана Узумаки, владельца самого сильного глаза-Риннегана надолго останутся в памяти фанатов сериала. Способности, которые позволяют Пейну держаться на второй строчке «Сильнейших»: владение Гентошин но Дзюцу, Шинра Тенсей, Баншо Тенин, Чибаку Тенсей, Фуидзюцу.
Этот персонаж обладает душещипательной предысторией. Он был добрейшим ребенком, склонным к состраданию. Его характер резко изменил факт убийства родителей. Персонаж присутствовал в этой сцене и хладнокровно расправился с убийцами.
Нагато основал Акацуки и стал сильнейшим Шиноби, не проиграв ни единого сражения в жизни. Он учился у легендарного Саннина Джирайи, которого однажды даже смог одолеть.
Пейн считает нормальным убийство во имя мира, поэтому он не прочь расправиться со «злыми» ниндзя. Парень назвал себя божеством, стал жестоким и кровожадным под влиянием идеи-фикс благополучия во Вселенной.
Речь Наруто в корне меняет мировоззрение Нагато. Он принимает свои ошибки и даже занимается искуплением грехов. Ему удается воскресить убитых, но приходится погибнуть самому.